Présentation de l'analyse des séquences génomiques fondée sur les automates finis. Détail des modèles markoviens utilisés. Chaque méthode est illustrée d'exemples, de figures et d'algorithmes. ©Electre 2024
Analyse statistique des séquences biologiques est le résultat de quinze années de recherche et présente de manière synthétique et didactique une approche nouvelle fondée sur les automates finis.
L'analyse statistique des séquences génomiques - un des points forts de la recherche en bioinformatique ou en biostatistique en France - développe des outils permettant la modélisation des séquences (chaînes de Markov, chaînes de Markov cachées) ainsi que l'étude des occurrences de motifs (par une approche novatrice fondée sur les automates finis déterministes). Elle permet également la recherche automatique de gènes et d'autres signaux biologiques (annotation) et compare des séquences provenant d'espèces différentes (alignement), en particulier pour reconstruire l'histoire de leur évolution (phylogénie).
Une présentation du domaine biologique et des divers modèles markoviens utilisés permet une lecture autonome. Les méthodes sont illustrées par de nombreux exemples et figures, les algorithmes qui leur correspondent sont systématiquement détaillés et l'on donne en référence les sites web et programmes qui permettent leur mise en oeuvre pratique.
Paru le : 18/06/2007
Thématique : Biologie
Auteur(s) : Auteur : Grégory Nuel Auteur : Bernard Prum
Éditeur(s) :
Lavoisier-Hermès
Collection(s) : Bioinformatique
Série(s) : Non précisé.
ISBN : 978-2-7462-1491-0
EAN13 : 9782746214910
Reliure : Broché
Pages : 361
Hauteur: 24.0 cm / Largeur 16.0 cm
Épaisseur: 1.6 cm
Poids: 570 g
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